Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms