Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp4Q9JKS5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms