Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb3Q9JKS4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb3Q9JKS4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms