Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nova1Q9JKN6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms