Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp39a1Q9JKJ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms