Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scamp5Q9JKD3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scamp5Q9JKD3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms