Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msgn1Q9JK54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msgn1Q9JK54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms