Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smpd3Q9JJY3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms