Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem47Q9JJG6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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