Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tulp4Q9JIL5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tulp4Q9JIL5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tulp4Q9JIL5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tulp4Q9JIL5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tulp4Q9JIL5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tulp4Q9JIL5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tulp4Q9JIL5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms