Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Praf2Q9JIG8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Praf2Q9JIG8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms