Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtaQ9JHK4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtaQ9JHK4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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