Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn12Q9ET43 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn12Q9ET43 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms