Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ParvbQ9ES46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ParvbQ9ES46 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms