Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Wdr61Q9ERF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms