Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms