Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dap3Q9ER88 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms