Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnn1Q9EQR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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