Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms