Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms