Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms