Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms