Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DA42 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DA42 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9DA42 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9DA42 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DA42 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DA42 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DA42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DA42 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DA42 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DA42 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DA42 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DA42 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9DA42 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DA42 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DA42 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DA42 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DA42 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DA42 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DA42 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms