Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmbim4Q9DA39 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms