Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhc1Q9D9T8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhc1Q9D9T8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms