Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2e2Q9D902 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms