Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chp2Q9D869 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chp2Q9D869 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms