Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn22Q9D7U6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms