Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbe1Q9D6Y9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbe1Q9D6Y9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms