Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms