Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer4f1Q9D5Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4f1Q9D5Q6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer4f1Q9D5Q6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms