Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930449I24RikQ9D5E3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930449I24RikQ9D5E3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms