Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930513O06RikQ9D549 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930513O06RikQ9D549 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms