Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms