Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus10Q9D3U0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pus10Q9D3U0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms