Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx29Q9D3S3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx29Q9D3S3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms