Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnal2Q9D3R6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms