Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim42Q9D2H5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim42Q9D2H5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms