Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snapc3Q9D2C9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Snapc3Q9D2C9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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