Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl8bQ9D1F0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms