Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc3Q9D114 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Hddc3Q9D114 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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