Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyc1Q9D0M3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyc1Q9D0M3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms