Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp3Q9D032 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms