Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc47Q9D024 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc47Q9D024 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms