Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmss1Q9CZT6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms