Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3110001I22RikQ9CZ70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3110001I22RikQ9CZ70 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms