Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mis12Q9CY25 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mis12Q9CY25 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms