Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms