Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdhdQ9CXV1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdhdQ9CXV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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