Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms